MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 108102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013159	CTG	2	6	11	16	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013159	GAGGG	2	10	77	86	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013159	AGC	2	6	93	98	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013159	GTC	2	6	126	131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054090
5	NC_013159	CAA	2	6	177	182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054090
6	NC_013159	CTG	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054090
7	NC_013159	CTG	2	6	234	239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054090
8	NC_013159	AGG	2	6	262	267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054090
9	NC_013159	GCC	2	6	428	433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
10	NC_013159	CGA	2	6	439	444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054090
11	NC_013159	CGC	2	6	454	459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
12	NC_013159	CA	3	6	479	484	50 %	0 %	0 %	50 %	257054090
13	NC_013159	CCCTC	2	10	497	506	0 %	20 %	0 %	80 %	257054090
14	NC_013159	ACG	2	6	541	546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054090
15	NC_013159	ATC	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054090
16	NC_013159	GCC	2	6	572	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
17	NC_013159	TCC	2	6	650	655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054090
18	NC_013159	CCG	2	6	664	669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
19	NC_013159	CCTCC	2	10	692	701	0 %	20 %	0 %	80 %	257054090
20	NC_013159	GAC	2	6	735	740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054090
21	NC_013159	CGA	2	6	746	751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054090
22	NC_013159	GCG	3	9	924	932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054090
23	NC_013159	GTCGCC	2	12	933	944	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257054090
24	NC_013159	G	6	6	982	987	0 %	0 %	100 %	0 %	257054090
25	NC_013159	CGGT	2	8	1021	1028	0 %	25 %	50 %	25 %	257054090
26	NC_013159	GGA	2	6	1079	1084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054090
27	NC_013159	TCA	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054090
28	NC_013159	CT	3	6	1106	1111	0 %	50 %	0 %	50 %	257054090
29	NC_013159	CGA	2	6	1115	1120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054090
30	NC_013159	CGC	2	6	1140	1145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
31	NC_013159	GACATC	2	12	1152	1163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257054090
32	NC_013159	AAGG	2	8	1197	1204	50 %	0 %	50 %	0 %	257054090
33	NC_013159	AGG	2	6	1210	1215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054090
34	NC_013159	TTC	2	6	1218	1223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054090
35	NC_013159	AACA	2	8	1251	1258	75 %	0 %	0 %	25 %	257054090
36	NC_013159	TCG	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054090
37	NC_013159	TCC	2	6	1269	1274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054090
38	NC_013159	CCG	2	6	1281	1286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
39	NC_013159	GAG	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054090
40	NC_013159	GCC	2	6	1355	1360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
41	NC_013159	GAA	2	6	1391	1396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054090
42	NC_013159	CGC	2	6	1445	1450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
43	NC_013159	GC	3	6	1483	1488	0 %	0 %	50 %	50 %	257054090
44	NC_013159	GAT	2	6	1607	1612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054090
45	NC_013159	CGG	2	6	1624	1629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054090
46	NC_013159	TTC	2	6	1632	1637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054090
47	NC_013159	GGA	2	6	1649	1654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054090
48	NC_013159	CCGC	2	8	1690	1697	0 %	0 %	25 %	75 %	257054090
49	NC_013159	ACCAC	2	10	1774	1783	40 %	0 %	0 %	60 %	257054090
50	NC_013159	AAG	2	6	1800	1805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054090
51	NC_013159	GCG	2	6	1826	1831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054090
52	NC_013159	CG	3	6	1880	1885	0 %	0 %	50 %	50 %	257054090
53	NC_013159	TCG	2	6	1895	1900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013159	A	7	7	2020	2026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013159	TGGA	2	8	2272	2279	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013159	TGA	2	6	2393	2398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013159	GCT	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013159	CA	3	6	2420	2425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013159	TAC	3	9	2438	2446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013159	TC	3	6	2456	2461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013159	AGA	3	9	2466	2474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013159	A	7	7	2474	2480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013159	CAC	2	6	2654	2659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_013159	TCA	2	6	2699	2704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013159	CA	3	6	2703	2708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013159	TCG	2	6	2713	2718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013159	GCC	2	6	2833	2838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054091
68	NC_013159	TGG	2	6	2851	2856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054091
69	NC_013159	TCC	2	6	2859	2864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054091
70	NC_013159	GCCC	2	8	3022	3029	0 %	0 %	25 %	75 %	257054091
71	NC_013159	CCA	2	6	3099	3104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054091
72	NC_013159	GCCC	2	8	3130	3137	0 %	0 %	25 %	75 %	257054091
73	NC_013159	GGCG	2	8	3148	3155	0 %	0 %	75 %	25 %	257054091
74	NC_013159	GAC	2	6	3215	3220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054091
75	NC_013159	GCA	2	6	3261	3266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054091
76	NC_013159	TCG	2	6	3276	3281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054091
77	NC_013159	CCG	2	6	3327	3332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054091
78	NC_013159	CGG	2	6	3348	3353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054091
79	NC_013159	CCCG	2	8	3362	3369	0 %	0 %	25 %	75 %	257054091
80	NC_013159	CGC	2	6	3382	3387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054091
81	NC_013159	CCG	2	6	3402	3407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054091
82	NC_013159	ACG	2	6	3410	3415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054091
83	NC_013159	GGCG	2	8	3430	3437	0 %	0 %	75 %	25 %	257054091
84	NC_013159	GGT	2	6	3461	3466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054091
85	NC_013159	CCG	2	6	3506	3511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054091
86	NC_013159	GCT	2	6	3520	3525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054091
87	NC_013159	ACT	2	6	3534	3539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054091
88	NC_013159	CG	4	8	3543	3550	0 %	0 %	50 %	50 %	257054091
89	NC_013159	TCG	2	6	3597	3602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054091
90	NC_013159	TCAGG	2	10	3616	3625	20 %	20 %	40 %	20 %	257054091
91	NC_013159	GGC	2	6	3655	3660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054091
92	NC_013159	GAC	2	6	3668	3673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054091
93	NC_013159	GGA	3	9	3685	3693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054091
94	NC_013159	CCG	2	6	3831	3836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054091
95	NC_013159	AGC	2	6	3901	3906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054091
96	NC_013159	GTG	2	6	4012	4017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054092
97	NC_013159	CGTCG	2	10	4047	4056	0 %	20 %	40 %	40 %	257054092
98	NC_013159	TGG	2	6	4067	4072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054092
99	NC_013159	GTG	2	6	4093	4098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054092
100	NC_013159	CGGC	2	8	4112	4119	0 %	0 %	50 %	50 %	257054092
101	NC_013159	GCG	2	6	4120	4125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054092
102	NC_013159	CGA	2	6	4161	4166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054092
103	NC_013159	GCT	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054092
104	NC_013159	GCC	2	6	4235	4240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054092
105	NC_013159	CGG	2	6	4272	4277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054092
106	NC_013159	GGT	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054092
107	NC_013159	CG	3	6	4339	4344	0 %	0 %	50 %	50 %	257054092
108	NC_013159	CGGG	2	8	4403	4410	0 %	0 %	75 %	25 %	257054092
109	NC_013159	GGA	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054092
110	NC_013159	CGG	2	6	4709	4714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054092
111	NC_013159	CG	3	6	4722	4727	0 %	0 %	50 %	50 %	257054092
112	NC_013159	TGCG	2	8	4760	4767	0 %	25 %	50 %	25 %	257054092
113	NC_013159	CGG	2	6	4791	4796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054092
114	NC_013159	TGG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054093
115	NC_013159	CG	3	6	5025	5030	0 %	0 %	50 %	50 %	257054093
116	NC_013159	GGT	2	6	5045	5050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054093
117	NC_013159	CCGGG	2	10	5091	5100	0 %	0 %	60 %	40 %	257054093
118	NC_013159	CGCGG	2	10	5121	5130	0 %	0 %	60 %	40 %	257054093
119	NC_013159	ACGTG	2	10	5141	5150	20 %	20 %	40 %	20 %	257054093
120	NC_013159	GTT	2	6	5171	5176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054093
121	NC_013159	GGA	2	6	5183	5188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054093
122	NC_013159	ACG	2	6	5219	5224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
123	NC_013159	GAC	2	6	5235	5240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
124	NC_013159	TGC	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054093
125	NC_013159	TTG	2	6	5316	5321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054093
126	NC_013159	GAG	2	6	5361	5366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054093
127	NC_013159	ACC	2	6	5407	5412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054093
128	NC_013159	GTT	2	6	5432	5437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054093
129	NC_013159	G	6	6	5546	5551	0 %	0 %	100 %	0 %	257054093
130	NC_013159	AGC	2	6	5602	5607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
131	NC_013159	CGT	2	6	5782	5787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054093
132	NC_013159	TGC	2	6	5824	5829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054093
133	NC_013159	GAC	2	6	5835	5840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
134	NC_013159	CAG	2	6	5858	5863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
135	NC_013159	CGA	2	6	5890	5895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
136	NC_013159	CGG	2	6	5917	5922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054093
137	NC_013159	CGA	2	6	5927	5932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
138	NC_013159	CGA	2	6	6025	6030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013159	GGC	2	6	6168	6173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054094
140	NC_013159	CGACGG	2	12	6242	6253	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257054094
141	NC_013159	CGA	2	6	6435	6440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054094
142	NC_013159	CTG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054094
143	NC_013159	GC	3	6	6500	6505	0 %	0 %	50 %	50 %	257054094
144	NC_013159	AAC	2	6	6589	6594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054094
145	NC_013159	CA	3	6	6633	6638	50 %	0 %	0 %	50 %	257054094
146	NC_013159	TGC	2	6	6647	6652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054094
147	NC_013159	CTG	2	6	6661	6666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054094
148	NC_013159	GT	3	6	7046	7051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013159	GAG	2	6	7066	7071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013159	GAA	2	6	7091	7096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054095
151	NC_013159	TCC	2	6	7113	7118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054095
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157	NC_013159	CGT	2	6	7298	7303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054095
158	NC_013159	CGA	2	6	7304	7309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054095
159	NC_013159	GGT	2	6	7425	7430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054095
160	NC_013159	CGGCGT	2	12	7436	7447	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257054095
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162	NC_013159	TGG	2	6	7546	7551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054095
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164	NC_013159	CGG	2	6	7647	7652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054095
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168	NC_013159	GCTCA	2	10	7749	7758	20 %	20 %	20 %	40 %	257054095
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171	NC_013159	TCGAGG	2	12	7873	7884	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257054095
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174	NC_013159	AC	4	8	7945	7952	50 %	0 %	0 %	50 %	257054095
175	NC_013159	GAG	2	6	7968	7973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054095
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179	NC_013159	AAG	2	6	8022	8027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054095
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182	NC_013159	TCGT	2	8	8163	8170	0 %	50 %	25 %	25 %	257054095
183	NC_013159	TGGC	2	8	8190	8197	0 %	25 %	50 %	25 %	257054095
184	NC_013159	TCA	3	9	8233	8241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054095
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186	NC_013159	CG	3	6	8276	8281	0 %	0 %	50 %	50 %	257054095
187	NC_013159	GGT	2	6	8325	8330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054095
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259	NC_013159	GCG	2	6	10709	10714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054096
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263	NC_013159	CAA	2	6	10806	10811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054096
264	NC_013159	CG	3	6	10825	10830	0 %	0 %	50 %	50 %	257054096
265	NC_013159	CTG	2	6	10888	10893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054096
266	NC_013159	AAG	2	6	10975	10980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054096
267	NC_013159	GAA	2	6	10989	10994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054096
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269	NC_013159	TGG	2	6	11069	11074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054096
270	NC_013159	GAC	2	6	11098	11103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054096
271	NC_013159	CTG	2	6	11104	11109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054096
272	NC_013159	GTC	2	6	11115	11120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054096
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280	NC_013159	GAC	2	6	11404	11409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054096
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286	NC_013159	ACC	2	6	11662	11667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054097
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291	NC_013159	GC	3	6	11859	11864	0 %	0 %	50 %	50 %	257054097
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307	NC_013159	CGG	2	6	12408	12413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
308	NC_013159	GCT	2	6	12439	12444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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312	NC_013159	GCC	2	6	12678	12683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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315	NC_013159	CGG	2	6	12775	12780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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376	NC_013159	TTGT	2	8	14891	14898	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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380	NC_013159	GAT	2	6	15031	15036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
381	NC_013159	GCG	2	6	15083	15088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
382	NC_013159	GCG	2	6	15104	15109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_013159	TCG	2	6	15116	15121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
384	NC_013159	CGG	2	6	15122	15127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
385	NC_013159	TTGC	2	8	15136	15143	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
386	NC_013159	GTG	2	6	15183	15188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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389	NC_013159	GTA	2	6	15300	15305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
390	NC_013159	CG	3	6	15330	15335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
391	NC_013159	TCC	2	6	15372	15377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054102
392	NC_013159	GCG	2	6	15381	15386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054102
393	NC_013159	TTC	2	6	15396	15401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054102
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395	NC_013159	GGT	2	6	15463	15468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054102
396	NC_013159	GCG	2	6	15489	15494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054102
397	NC_013159	GTG	2	6	15527	15532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054102
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401	NC_013159	CGG	2	6	15723	15728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054102
402	NC_013159	GAT	2	6	15743	15748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054102
403	NC_013159	GGT	2	6	15752	15757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054102
404	NC_013159	GTCG	2	8	15783	15790	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
405	NC_013159	GC	3	6	15889	15894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
406	NC_013159	TGT	2	6	15911	15916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_013159	GCC	2	6	16138	16143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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420	NC_013159	ACC	2	6	16422	16427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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499	NC_013159	CGGTGT	2	12	19492	19503	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	257054107
500	NC_013159	GTGATC	2	12	19512	19523	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257054107

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